Le SyGR mène des études préalables à la réalisation de travaux d'aménagement des cours d'eau et des berges. Ces études ont pour but de définir des aménagements répondant aux enjeux hydrauliques, prévention des inondations, écologiques et paysagers de chaque tronçon.

Le choix des aménagements retenus se fait sur la base d'une analyse tenant compte des gains sur chacun de ces domaines, des coûts de réalisation, et du caractère durable des aménagements.

Pour chaque opération, le SyGR développe un partenariat renforcé avec les acteurs concernés au sein d'un comité de pilotage.